可使用支付宝等移动支付方式
绍兴城际线开进火车南站之后，初期开通4对市域列车，分别是杭州南—绍兴S2101、S2103次2列，上虞—杭州南S2102、S2104、S2106/S2105、S2108/S2107次6列。
以S2101次列车为例，9点06分从火车南站始发，9点20分到达钱清站，9点38分到达绍兴站。从火车南站至绍兴火车站的耗时在半小时左右。
火车南站与上虞火车站间的耗时则需1小时左右，以S2106次列车为例，17点48分从上虞火车站开出，18点08分到达绍兴站，18点29分到达钱清站，18点50分终到火车南站。
目前，杭州市民可使用自动购票机购票乘车，也可使用支付宝等移动支付方式乘车，杭州通卡暂不能使用。
需要提醒市民的是，绍兴城际线并不在火车南站的候车大厅内乘坐，而是在西广场设有专门的候车区。候车区进站口位于站房西侧一层，有玻璃围挡，玻璃上有“绍兴城际欢迎您”的招贴。
市民乘坐公交、地铁到达火车南站后，可注意各处导向标识上的“绍兴城际”字样，跟着这个标识走，就能找到绍兴城际线的候车区。
